Il est important de rappeler que la douleur n’est pas corrélée avec l’importance des lésions d'endométriose. En effet, leur intensité de la douleur n’est liée ni au volume, ni à la taille des lésions, mais à leur profondeur de pénétration dans la paroi des organes. En cas de lésions profondes, des douleurs peuvent d’ailleurs survenir lors des changements de position.

Les douleurs d'endométriose se manifestent surtout dans la région pelvienne (partie inférieure du ventre), mais aussi dans l'abdomen et la région lombaire et sont souvent rythmées par les cycles menstruels et peuvent être dues :

• aux lésions d'endométriose elles-mêmes ;
• à l'envahissement de nerfs par ces lésions ;
• aux réactions inflammatoires de l’organisme ;
• aux adhérences fibreuses et cicatricielles qui se développent parfois entre les organes touchés.

Les douleurs se manifestent parfois en permanence. Toutefois, dans la plupart des cas, elles sont récurrentes, rythmées par le cycle menstruel, plus marquées au moment de l’ovulation et surtout des règles (dysménorrhées ou règles douloureuses).